Cohorte COFI (« Cohorte Fibrose ») (2007-2015) : initiée et coordonnée par D Valeyre (Service de Pneumologie Hôpital Avicenne) afin d’étudier l’histoire naturelle de la FPI en France. Il s’agit d’une cohorte prospective multicentrique impliquant les 36 départements Universitaires de Pneumologie de France métropolitaine. 265 patients avec FPI incidente ont été inclus entre 2007 et 2010, et suivis tous les 3 mois pendant 5 ans. Une biobanque (sérum, cellules sanguines circulantes, cellules et liquide de lavage bronchoalvéolaire, ADN) a été constituée. (Financement : PHRC IDF # AOR07076, Chancellerie des Universités de Paris – Fondation du Legs Poix).
Cohorte IPF-AE (« Mechanisms and Biomarkers of Acute Exacerbation in IPF ») (2012-…) : cohorte prospective multicentrique Européenne de patients avec FPI incidente visant à identifier les mécanismes et les biomarqueurs d’exacerbation aiguë dans la FPI, coordonnée par le Pr A Prasse (Univ. Freiburg, Allemagne) (Investigateur principal France : D Valeyre ; responsable scientifique France : C Planès). 200 patients avec FPI incidente ont été recrutés sur une période d’un an dans 6 centres recruteurs en Europe (Allemagne, Italie, France, Grèce), puis suivis tous les 3 mois pendant 30 mois. Une biobanque et une cellulothèque a été constituée (sans, lavage bronchoalvéolaire, urines) pour permettre des analyses transcriptomiques, protéomiques, gllycomiques , … . (Financemnt : Communauté Européenne, E-rare project 2011, distribué en France par l’ANR).
Cohorte PID-93 (« Pneumopathies Interstitielles Diffuses en Seine Saint-Denis ») (2012) : cohorte de patients avec PID incidente ou prévalente vivant en Seine Saint-Denis, pour l’étude de l’épidémiologie des PID en Ile de France (coordonnateur : H Nunes). 1.170 patients inclus entre janvier et décembre 2012 par l’ensemble des spécialistes des Hôpitaux publiques et privés, les pneumologues de ville et les médecins généralistes, et la CPAM du 93. (Financement : Chancellerie des Universités de Paris – Fondation du Legs Poix).
SPS-net (Registre Français online de Sarcoïdoses Pulmonaires Sévères) : registre national compilant les données épidémiologiques et cliniques des cas de sarcoïdose pulmonaire sévère, initié en 2016 et coordonné par D Valeyre. (Financement : Chancellerie des Universités de Paris – Fondation du Legs Poix ; Foundation for Sarcoidosis Research, USA).
Cohorte SHAI (Severe High Altitude Illness) : cohorte d’environ 5 000 sujets (300 nouveaux sujets / an) ayant bénéficié d’un test d’exercice en hypoxie en consultation de Médecine d’Altitude (JP Richalet, Service de Physiologie, Explorations Fonctionnelles et Médecine du Sport, Hôpital Avicenne). Cette cohorte permet l’étude des facteurs de risques des pathologies de haute altitude. Un élargissement national de la cohorte est actuellement en cours (Etude multicentrique MultiSHAI), avec la participation de 22 centres sur le territoire Français.
Cohorte MONGE (maladie de Monge ou mal chronique des montagnes) (coordonnateur : JP Richalet) : en collaboration avec l’Université Cayetano Heredia au Pérou, 350 sujets sains ou polyglobuliques atteints de la maladie de Monge et vivant à 4300 m d’altitude à Cerro de Pasco ont été recrutés pour étudier les facteurs de risque génétiques de la maladie (GWAS en collaboration et avec l’aide financière du Labex GrEx dirigé par O Hermine).